La pérdida de bosques integra las pérdidas naturales y antrópicas, esta última es la que se la denomina "deforestación", actualmente la pérdida de bosques, no considera las pérdidas ocurridas por la migración del cauce de ríos, las cuales han podido separarse durante el proceso metodológico, no pudiéndose separar las otras pérdidas naturales por temas técnicos del proceso.

La metodología desarrollada por el PNCBMCC utiliza todas las imágenes Landsat L1TP disponibles para el periodo evaluado, estas imágenes pasan por un procesamiento digital de imágenes de satélite, mediante el método de Desmezcla Espectral Directa (DSU); y con ello realiza la clasificación de la pérdida de bosques bajo el Modelo Lineal de Mixtura Espectral (MLME), el detalle de la detección es de hasta 25 % de la pérdida de cobertura de bosque; para la post-clasificacion se realiza de manera conjunta con el equipo de especialistas del Servicio Nacional Forestal y de Fauna Silvestre (SERFOR) y el PNCBMCC.

Los datos del 2001 al 2016 han sido generados bajo la metodología propuesta por la Universidad de Maryland (UMD), para los datos del 2017 a la actualidad son generados bajo la metodología propuesta por el PNCBMCC.

La información de Bosque y No Bosque, toma como "Línea Base" el año 2000, año en que se identificaron las coberturas de "Bosque" y "No Bosque", a partir de ese año se monitorea la "Pérdida de bosques" anualmente.